Правильно: собравшись с духом.
Правильно: Не хлебом единым.
Устойчивое сочетание ни сном ни духом пишется без запятой.
Продолжение фразы все объясняет: ...А всяким словом Божиим.
Тире здесь не нужно.
Верно: не облагаемые единым налогом.
Да, следует поставить запятые.